Брюшно-анальная резекция является сфинктеросохраняющей операцией, однако при этой операции полностью удаляется вся прямая кишка, а на её местно низводится вышележащая сигмовидная кишка. В связи с этим чувство наполнения кишки, острота позывов в туалет, а также сила удержания могут изменяться после операции.

Подавляющее большинство пациентов сохраняют функцию удержания, однако следует помнить, что функционирование сфинктерного аппарата после брюшно-анальной резекции может изменяться, и потребуется определённое время для адаптации к новым условиям. Основным фактором восстановления функции удержания является время. Травмированный сфинктер восстанавливается после хирургического вмешательства, пациент адаптируется к новым ощущениям и новому режиму функционирования кишки. Первое время отхождение стула может быть полностью неконтролируемым. Чтобы ускорить процесс реабилитации рекомендуются специальные упражнения по тренировке мышц сфинктера, возможно также прохождение курса электростимуляции, который значительно ускоряет скорость восстановления функции удержания.

Для контролирования отхождения каловых масс целесообразно использование диет, изменение кратности приёма пищи, строгое соблюдение времени приёмов пищи. Проведение очистительных клизм 2 раза в день в первые недели после операции позволяет полностью регулировать частоту опорожнения кишечника.